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Este estudio demuestra que los Xenobots, constructos vivos sintéticos derivados de células de Xenopus sin cerebro, exhiben comportamientos adaptativos y forman memorias específicas a largo plazo tras la exposición a estímulos químicos, evidenciadas mediante cambios fisiológicos, de señalización de calcio y transcripcionales.
Este estudio presenta el diseño de novo de metaloproteasas mediante el modelo generativo Proteus2 para lograr una escisión específica y eficiente de la proteína beta-amiloide, clave en la enfermedad de Alzheimer, validando experimentalmente enzimas que aceleran la hidrólisis del enlace peptídico más de 107 veces con alta especificidad y confirmando su estructura mediante criomicroscopía electrónica.
Este artículo presenta un marco de control robusto basado en redes de reacciones químicas que permite el seguimiento estable de productos multiplicativos y monomiales arbitrarios de concentraciones de especies biomoleculares, validando teórica y numéricamente su eficacia para el diseño de dispositivos biomoleculares autorregulados.
Este estudio demuestra que la sobreexpresión de curli y Antígeno 43 en *Escherichia coli* permite una adhesión programable a superficies plásticas, lo que, al combinarse con la secreción de la enzima PHL7, aumenta significativamente la degradación del PET y la liberación de ácido tereftálico.
Los investigadores demostraron que un autoencoder variacional entrenado con dominios de unión al ADN de la familia LuxR puede generar proteínas híbridas con nuevas especificidades de unión al ADN, permitiendo diseñar factores de transcripción que reconocen y activan simultáneamente los promotores *lux* y *las*.
Los autores desarrollaron un marco integral que utiliza la hipermutación continua y la evolución dirigida de sintasas de aminoácidos en levadura para biosintetizar intracelularmente aminoácidos no canónicos, superando así la dependencia de suministros externos y permitiendo la expansión del código genético de manera más escalable y rentable.
Este estudio presenta un enfoque transformador para crear neuronas biónicas que sintetizan autónomamente fibrillas fluorescentes integradas, las cuales actúan como neuromoduladores capaces de alterar las propiedades eléctricas de la membrana y abrir la puerta a la ingeniería de circuitos neuronales funcionales directamente dentro de organismos vivos.
Este estudio demuestra la optimización de la ruta biosintética de glucosinolatos simples en *Escherichia coli* mediante la ingeniería de enzimas y la mejora del suministro de sulfato, logrando un aumento de 37 veces en la producción de benzil glucosinolato y estableciendo la primera síntesis microbiana de indol-3-metil glucosinolato con un rendimiento récord de 1250 µM.
Este estudio presenta Fung-AI, una pipeline impulsada por inteligencia artificial que utiliza redes generativas adversarias para diseñar y validar exitosamente nuevos péptidos antifúngicos con actividad contra patógenos como *Fusarium graminearum* y *Candida albicans*, demostrando la viabilidad de este enfoque para el descubrimiento rápido de terapias.
El artículo presenta VenusRXN, un marco de aprendizaje profundo multimodal que supera los métodos tradicionales basados en homología para descubrir enzimas mediante la alineación precisa de representaciones químicas y biológicas, logrando éxitos en la identificación de biocatalizadores para reacciones no vistas, incluida la síntesis de un intermediario de fármacos para la diabetes tipo 2, mediante una búsqueda cero-shot en espacios proteicos masivos.
Este estudio demuestra que los ciclos periódicos de hidratación y deshidratación pueden impulsar, mediante transformaciones biofísicas de membranas simples, dinámicas de crecimiento, división y encapsulación de macromoléculas en protocélulas mínimas sin necesidad de reacciones químicas complejas.
Este estudio combina modelado bioquímico estocástico y análisis de teoría de la información para cuantificar cómo la retroactividad limita la transmisión de señales en circuitos sintéticos y propone principios de diseño que permiten tanto mitigar sus efectos negativos como aprovecharla funcionalmente para la toma de decisiones celulares.
Los autores integraron un sistema CRISPRi en *Pseudomonas putida* con una plataforma de mini-bioreactores automatizados en modo turbidostato para superar las limitaciones de los cultivos por lotes, permitiendo así mapear con precisión la dinámica temporal de la silenciamiento génico y disociar las respuestas fisiológicas transitorias de la aparición de mutantes evasores mediante análisis multi-ómicos.
Este estudio presenta una plataforma de virología sintética que utiliza la recombinación asociada a transformación en levaduras para generar y rescatar quimeras infecciosas de poxvirus con diversidad genómica y mejorada actividad oncolítica, estableciendo así un nuevo enfoque para el diseño de terapias contra el cáncer.
Este estudio de prueba de concepto demuestra que la ingeniería genética de *Saccharomyces cerevisiae* mediante un enfoque de biología sintética permite producir vesículas extracelulares diseñadas y cargadas con proteínas humanas, identificando a Bro1 como el andamio más eficiente para este fin.
Los investigadores desarrollaron andamios proteicos modulares que ensamblan enzimas hidrolíticas en cascada para despolimerizar eficientemente el PET en sus monómeros, superando las limitaciones cinéticas y de inhibición de los sistemas anteriores mediante estrategias de inmovilización y biocatálisis celular.
Este estudio demuestra que los modelos de lenguaje genómico actuales, como Evo 2 y megaDNA, presentan limitaciones fundamentales al generar genomas sintéticos realistas, ya que aunque capturan estadísticas locales, fallan sistemáticamente en preservar la organización a larga distancia, las repeticiones y las restricciones evolutivas, lo que permite distinguirlos fácilmente de secuencias naturales.
Este estudio demuestra que la expansión experimental de la diversidad en bibliotecas de genes mediante síntesis a gran escala y reordenamiento de ADN permite convertir la extrapolación en interpolación para los modelos de lenguaje de proteínas, facilitando así el descubrimiento de nuevas proteínas fluorescentes funcionales en regiones previamente inexploradas del espacio de secuencias.
Los autores demuestran que la plataforma CADGE 2.0 mejora significativamente la replicación de ADN y la expresión génica acoplada en un sistema libre de células al sustituir las mezclas de energía comerciales por contrapartes optimizadas para la replicación de ADN.
El estudio demuestra que los modelos de lenguaje grandes, como Gemini 2.5 Pro, pueden realizar la verificación de legitimidad de pedidos de ácidos nucleicos sintéticos con una precisión comparable a la de expertos humanos y a una fracción del costo, lo que respalda su implementación como herramienta de apoyo para la criba de seguridad en biotecnología.